{"Día 1"=>[#<Jekyll::Document _posts/2024-10-21-Day1.md collection=posts>], "Día 2"=>[#<Jekyll::Document _posts/2024-10-22-Day2.md collection=posts>], "Día 3"=>[#<Jekyll::Document _posts/2024-10-23-Day3.md collection=posts>], "Cellpose"=>[#<Jekyll::Document _posts/2024-10-24-InstallCellpose.md collection=posts>], "Qupath"=>[#<Jekyll::Document _posts/2024-10-25-aInstallQupath.md collection=posts>, #<Jekyll::Document _posts/2024-10-25-QupathProjects.md collection=posts>]}

Sesiones prácticas y teóricas en el manejo de datos multiplex.

Aprenderemos el uso de Cellpose para la clasificación de marcadores de inmunofenotipo.

Día 2 (19 Noviembre 2024)

Día 2  · 

09:00 - 10:30

Uso de Cellpose para Segmentación

Instructor: Paul Hernández & Haydee Hernández

  1. Introducción a Cellpose
  2. Instalación de Cellpose con su GUI
  3. Práctica: Ajuste de parámetros de Cellpose
  4. Práctica: Segmentación de núcleos con Cellpose

Presentación

Guía de instalación

Descargar imágenes

10:30 - 10:40

Coffee break

10:40 - 12:15

Aprendizaje Automático para clasificación de Marcadores

Instructor: Saraí De León

  1. Preprocesamiento y organización de datos
  2. Anotación de marcadores positivos y negativos con Annotater
  3. Generación de modelo para clasificación de marcadores con Annotater
  4. Clasificación de marcadores con Annotater

Presentación

Instalación Annotater en FIJI

12:15 - 12:45

Almuerzo

10:30 - 10:40

Coffee break

10:40 - 12:15

Aprendizaje Automático para clasificación de Marcadores

Instructor: Saraí De León

  1. Preprocesamiento y organización de datos
  2. Anotación de marcadores positivos y negativos con Annotater
  3. Generación de modelo para clasificación de marcadores con Annotater
  4. Clasificación de marcadores con Annotater

Presentación

Instalación Annotater en FIJI

12:15 - 12:45

Almuerzo

12:45 - 14:00

Generación e interpretación de resultados (Parte 1)

Instructor: Saraí De León

  1. Práctica: Generación de datos en batch
  2. Resultados de datos obtenidos con Annotater
  3. Interpretación de los resultados
  4. Conclusiones y resultados finales